Hola. Por la descripción de la situación entiendo que la compra y la venta se produjo en el mismo ejercicio (2020) por lo que el único impacto en la ddjj de ganancias sería lo que ganó o perdió entre ambas operaciones.
Los gastos que hayas deducido por ser un bien afectado a la actividad se mantienen sin cambios.
Si las operaciones de compra y venta cuentan con sus respectivas transferencias en el registro automotor, no deberían generarse diferencias con los datos de AFIP. Si la venta no fue inscripta en el registro, pero tenés documentación que la sustenta, deberías guardar esa documentación en tus papeles de trabajo para exhibir en caso de que te lo requieran.